Mettez vos talents de stratège à l'épreuve et aidez Mario (et ses Mini Mario) à sauver Pauline des griffes du célèbre Donkey Kong avec l'arrivée de Mario vs. Donkey Kong: Pagaille à Mini-Land!, une aventure basée sur la résolution d'énigmes, remplie de tout nouveaux défis et autres jeux.

Dans le nouvel opus de la série Mario vs. Donkey Kong, Mario inaugure un parc d'attractions flambant neuf et convie son amie Pauline en tant qu'invitée spéciale pour fêter l'évènement. Mais l'ambiance va bientôt s'assombrir avec l'arrivée de Donkey Kong qui est très en colère et décide d'enlever Pauline sous la moustache de Mario !

Pour sauver Pauline des griffes de Donkey Kong, vous allez devoir diriger un groupe de jouets miniatures de Mario dans des niveaux labyrinthiques disposant chacun d'une porte de sortie. Vous devrez utiliser tous les outils mis à votre disposition pour modifier le chemin pris par les Mini Mario : en dessinant des ponts, en créant des échelles et en déplaçant des ressorts et des blocs, pour veiller à ce qu'ils évitent les pièges et les ennemis sur leur chemin !